XAMPP1.6.8、PDT2.0でのPHPスクリプトのデバッグ設定について。 不完全であり、解決できない問題があり。
ウィンドウ > 設定 > PHP > PHP実行ファイルの設定
から実行ファイルを設定します。

色々なVerのPHPの実行ファイルを登録した場合に区別がつくようにします。適当でOK。 ここではPHP5とします。
実行ファイルとはPHPを実行するファイルです。そのままで説明になってませんが Windowsならexeファイルのことだと思ってればいいはずです。 なのでXAMPPの場合、XAMPP/php/php.exe を指定します。
基本apacheがロードするphp.iniを指定します。 サーバのphp.iniとデバッグ用のphp.iniを別にしたい場合は、 php_debug.iniとか作ってやればいいかと思います。
利用するデバッガーを指定します。
XAMPPがロードするphp.iniはXAMPP/apache/bin/php.iniとなります。 下の方にある[Zend]の部分を探すと下記のようになっています。